隠しユニット・パイロット
| ユニット・キャラ | 入手方法 |
| VF-1JバルキリーorVF-11CFAサンダーボルト |
1.「地球が消えた日」敵を全滅させた後「遺跡内に突入し、救助に向かう」を選択する。 2.「少年たちは戦場に帰る」クリアまでにガムリンの撃墜数を一定数以上にして「戦う市長 エースのミリア！」で「ガムリンのため機体を探す」を選択すると入手できる。 （ガムリンの撃墜数が0～5機の場合は入手不可になり、6～9機の場合はVF-1Jバルキリーが入手でき、10機以上なら2機から選択できる。） |
| ガンダムMk-Ⅲ | 「強襲！ ギシン星間帝国ベガ艦隊」クリア後「木星に行く」を選択すると「ジュピター・ミラージュ」で入手できる。 |
| νガンダムHWS装着型 | 「強襲！ ギシン星間帝国ベガ艦隊」クリア後「カイラスギリー攻略作戦に参加する」を選択し「対決！ マーズとマーグ」クリアまでにアムロの撃墜数が50機以上なら「カイラスギリー攻略戦」で入手できる。 |
| B・D（ザーメ＝ザウ） | 「背中ごしのセンチメンタル」で省吾がB・Dを撃墜するとクリア後仲間になる。 |
| ヴァイエイト | 「PLANET DANCE」クリアまでにノインとヒルデの撃墜数の合計が10機以上なら「ザール艦隊総司令クロッペンの挑戦！」で入手できる。 |
| メリクリウス | 「PLANET DANCE」クリアまでにノインとヒルデの撃墜数の合計が20機以上なら「ザール艦隊総司令クロッペンの挑戦！」でヴァイエイトと同時に入手できる。 |
| グラキエース（ファービュラリス） |
「アイスドール グラキエース」でグラキエースを主人公で説得し、「生と死の呪縛」でグラキエースを主人公で説得して「システムをカットしない」を選択すると「誇り高き反逆者」で主人公機に乗って登場してそのまま仲間になる。 （男主人公の場合のみ仲間になる、仲間になると副主人公は使用できなくなる。） |
| フェントス（ストゥディウム） |
「運命の風」で「話を聞く」を選択し、「生と死の呪縛」で「システムをカットしない」を選択すると「私に、さようなら」クリア後仲間になる。 （女主人公の場合のみ仲間になる、仲間になると副主人公は使用できなくなる。） |
| フルアーマーZZガンダム | 「誇り高き反逆者」クリアまでにジュドーとルーの撃墜数の合計が40機以上なら「戦場の父 戦場の子」で入手できる。 |
| V2アサルトバスターガンダム | 「戦場の父 戦場の子」クリア後「エンジェル・ハイロゥ攻略」を選択すると「狂乱のエンジェル・ハイロゥ」以降から換装できるようになる。 |
| キャノンキュービック＆火炎アタック火炎十文字斬り＆超空間エネルギー開放（追加武器） |
「戦場の父 戦場の子」クリア後「旧エリオス領へ向かう」を選択すると「反逆のクロッペン」でダルタニアスに武器が追加される。 （超空間エネルギー開放は気力が140以上の時のみ画面に表示される。） |
| ハマーン（キュベレイ） |
1.「戦場の父 戦場の子」クリア後「エンジェル・ハイロゥ攻略」を選択し、「幻覚と踊れ」クリアまでにアムロ、シャア、カミーユ、ジュドーの撃墜数の合計を400機以上にする。 2.「狂乱のエンジェル・ハイロゥ」の後半のマップでアムロ、シャア、カミーユ、ジュドーを出撃させ撃墜されずクリアすれば「暗黒の皇帝」で仲間になる。 |
| マーグ（ガイヤー） |
1.「銀河の虎」「誇り高き反逆者」でマーグをタケルで説得する。 2.「戦場の父 戦場の子」クリア後「旧エリオス領へ向かう」を選択しマーグをタケルで説得してゴットマーズに乗っているマーグをタケルで撃墜する。 3.「暗黒の皇帝」クリア後「ギシン星間帝国へ向かう」を選択すると「反乱惑星の対決！」でパイロットとして使用できるようになる。 （気力が120以上になるとゴットマーズに合体できる。） |
| クロノクル（リグ・コンティオ）＆カテジナ（ゴトラタン） |
1.「戦場の父 戦場の子」クリア後「エンジェル・ハイロゥ攻略」を選択し、「幻覚と踊れ」でクロノクル、カテジナ登場後にタシロを撃墜する。 2.「狂乱のエンジェル・ハイロゥ」の前半のマップでウッソがカテジナ、クロノクルと戦闘をして後半のマップでカテジナ、クロノクルの順番でウッソが説得すると「反乱惑星の対決！」か「禁断惑星のシビル」でパイロットとして使用できるようになる。 |
| シビル | 「暗黒の皇帝」クリア後「惑星ラクスへ向かう」を選択し「響け銀河に オレたちの歌」でバサラとゲペルニッチが戦闘をするとクリア後仲間になる。 |
| ロゼ（ゼローン） | 1.「暗黒の皇帝」でロゼをタケルで説得する。 2.「暗黒の皇帝」クリア後「ギシン星間帝国へ向かう」を選択した場合は「反乱惑星の対決！」、「惑星ラクスに向かう」を選択した場合は「”破滅”の意味」で仲間になる。 （説得しなった場合はコスモクラッシャーのサブパイロットになる。） |
| 反応弾（追加武器） | 「暗黒の皇帝」クリア後「惑星ラクスへ向かう」を選択すると「決心の防衛」でサウンドフォース以外のマクロス7系の機体に追加される。 |
| ガビル（FBz-99Gザウバーゲラン） |
1.「暗黒の皇帝」クリア後「惑星ラクスへ向かう」を選択し「悪夢の突入作戦」の後半のマップガムリンとガビルが戦闘をする。 2.「響け銀河に オレたちの歌」でガムリンとガビグラに乗っている状態のガビルが戦闘をするとクリア後に仲間になる。 |